潜水搅拌机主要应用于市政、工业和城镇居民生活污水处理过程中的混合、搅拌和环流，如活性污泥池、生物反应池、搅拌池、贮泥井、均衡池、污水池等；景观水环境的养护设备，创建水流；增加水中含氧量，改善水体质量；有效阻止悬浮物沉积等场合。
潜水搅拌机在污水处理工程中的应用主要有以下四个方面13
(1)进行水力循环。在厌氧池、缺氧池和氧化沟等池中只需提供必要的循环流 速就可以保持池内的混合液呈悬浮状态，使微生物与基质充分接触，通过搅拌器输入的能量，形成连续循环水流，这种设计不仅能有效地保持混合液悬浮，而且由于池内循环水流的流量通常高于进水流量数十倍甚至上百倍，使池内水流产生了巨大的稀释均化能力，因而这种反应器具有耐受冲击负荷的优良工艺特性。
(2)提高传氧效率。曝气是维持好氧微生物正常代谢的基本手段，水下曝气系统的传氧效率又与水深有着直接的关系。在曝气池中釆用潜水搅拌机将曝气池设计成上述连续循环流池型，就会在循环流速的作用下，改变由曝气头释放“气泡”的路径，增大“传氧水深”,提高传氧效率。釆用这种设计通常可使曝气系统的传氧效率提高15%左右，污水处理的能耗与运行费用也随之节省。
(3)方便分格、分段处理。当单格池容积较小时，可将每格设计成正方形平面或圆形平面，并在每格中设置一台污水处理搅拌机
(4)改善水体水质。在许多受到污染的水体和污水处理所用的深度处理塘中 往往会遇到水深较大、水流滞缓、水体表面复氧不能保证深水区溶氧要求等情况， 可以设置搅拌机进行“人工呼吸”为深水区复氧，改善整个水体的水质。这种“人工呼吸”技术是一种简单有效的水质改善手段。
